Um seinen Bruder vor dem Tode zu bewahren, begeht Michael Scofield einen bewaffneten Banküberfall und wird daraufhin in die Fox River Strafanstalt eingewiesen. Dort sitzt ebenfalls sein Bruder ein, der für den Mord des Bruders der Vizepräsidentin zum Tode verurteilt wurde. Einzig und allein Michael glaubt an seine Unschuld und beschließt, zusammen mit seinem Bruder aus dem Gefängnis auszubrechen.